鄂爾多斯市中心醫(yī)院始建于1950年，是鄂爾多斯唯一的三級甲等綜合醫(yī)院，是內(nèi)蒙古醫(yī)科大學臨床醫(yī)學院，成立了內(nèi)蒙古自治區(qū)超聲影像研究所，是自治區(qū)超聲質(zhì)量控制中心，擁有國家級臨床重點建設(shè)專科重癥醫(yī)學科和自治區(qū)領(lǐng)先學科超聲醫(yī)學科。

醫(yī)院是國家臨床藥師培訓基地和國家住院醫(yī)師規(guī)范化培訓基地。建立了國家消化疾病臨床醫(yī)學研究中心分中心、京蒙合作消化疾病醫(yī)療中心、胸痛中心、心衰中心、頭痛中心、卒中中心。影像醫(yī)學、超聲醫(yī)學等專業(yè)水平居于自治區(qū)先進地位。消毒供應(yīng)中心是自治區(qū)實踐基地。神經(jīng)專業(yè)、腫瘤專業(yè)、心內(nèi)專業(yè)、呼吸專業(yè)成為自治區(qū)臨床醫(yī)學研究中心核心成員單位。

醫(yī)院設(shè)置康巴什部和東勝部，總建筑面積26萬平方米，開放床位1700張。擁有PET-CT（最新數(shù)字PET）、寶石CT、3.0T核磁共振、彩超、血管造影機等先進醫(yī)療設(shè)備。

醫(yī)院近三年先后獲評全國“全國衛(wèi)生計生系統(tǒng)先進集體”“中國醫(yī)院百強院”“自治區(qū)平安醫(yī)院示范單位”等榮譽稱號。