上海市兒童醫(yī)院是一所集醫(yī)療、保健、教學、科研、康復(fù)于一體的三級甲等兒童醫(yī)院，前身是由我國著名兒科專家富文壽及現(xiàn)代兒童營養(yǎng)學創(chuàng)始人蘇祖斐等前輩于1937年創(chuàng)辦的上海難童醫(yī)院，1953年更名為上海市兒童醫(yī)院，是我國第一家兒童?？漆t(yī)院。2003年成為上海交通大學附屬兒童醫(yī)院，2022年更名為上海交通大學醫(yī)學院附屬兒童醫(yī)院。
醫(yī)院擁有瀘定路和北京西路兩個院區(qū)，為長三角地區(qū)兒童醫(yī)療聯(lián)盟和上海市西部兒聯(lián)體牽頭單位。醫(yī)院開放床位793張，現(xiàn)有員工近1700人。醫(yī)院擁有中國工程院院士1名、博士生導師19名、碩士生導師39名，擁有高級職稱專家200余名。
醫(yī)院學科綜合實力雄厚，目前共設(shè)38個院級學科，并擁有一批高質(zhì)量的國家級和省部級學科，包括國家重點學科1個（遺傳學），國家臨床重點?？?個（重癥醫(yī)學和醫(yī)學胚胎分子生物學重點實驗），衛(wèi)生部及上海市重點實驗室1個（重癥醫(yī)學和醫(yī)學胚胎分子生物學重點實驗），上海市工程技術(shù)研究中心1個（上海市兒童精準醫(yī)學大數(shù)據(jù)工程技術(shù)研究中心），上海市衛(wèi)健委重中之重臨床重點學科1個（醫(yī)學遺傳學）、上海市臨床重點專科3個（出生缺陷防治、即時檢測、臨床藥學），上海市公共衛(wèi)生重點學科1個（兒?？疲?，上海交通大學醫(yī)學院地方高水平大學的建設(shè)項目1項（兒童感染免疫與重癥醫(yī)學研究院）。醫(yī)院是上海市兒童早期發(fā)展基地，是上海醫(yī)學遺傳研究所、上海市兒童急救中心、上海市新生兒篩查中心、上海市兒童康復(fù)中心、上海市聽力障礙診治中心、上海市新生兒先心篩查診治中心依托單位以及上海市人工耳蝸植入手術(shù)定點醫(yī)療機構(gòu)。上海醫(yī)學遺傳研究所作為國家衛(wèi)健委命名的中國醫(yī)學遺傳中心基因診斷部，研究發(fā)展了一整套遺傳病分子診斷技術(shù)，在我國最早開展了苯丙酮尿癥、血友病、DMD等罕見遺傳病的基因診斷和產(chǎn)前診斷工作。作為國家首批運用高通量測序技術(shù)開展遺傳病診斷的試點單位之一，上海市兒童醫(yī)院在兒童遺傳病的基因檢測領(lǐng)域居國內(nèi)領(lǐng)先地位。
近年來，醫(yī)院以建設(shè)“精品醫(yī)院、人文醫(yī)院、智慧醫(yī)院”為發(fā)展目標。在精品醫(yī)院方面，醫(yī)院?？圃\療技術(shù)特點鮮明。重癥醫(yī)學團隊在ECMO、CRRT搶救技術(shù)方面居于國內(nèi)領(lǐng)先地位；腎臟科開展生物制劑靶向治療，在疑難及遺傳腎臟病方面具有診療優(yōu)勢；普外科攜手華山醫(yī)院組建了“華山-兒童肝移植團隊；內(nèi)分泌科牽頭制定了國內(nèi)兒童性發(fā)育異常內(nèi)分泌診斷與治療共識；泌尿外科開展國內(nèi)首例小兒泌尿外科機器人輔助腹腔鏡手術(shù)，填補了國內(nèi)小兒泌尿外科該項技術(shù)的空白;神經(jīng)外科、骨科、兒童康復(fù)科組建的醫(yī)療團隊率先在國內(nèi)兒童功能神經(jīng)康復(fù)領(lǐng)域開展了SDR手術(shù)，顯著改善腦癱兒童的下肢行走功能；消化科開展FMT腸道菌群移植并成功研制腸溶糞菌膠囊；耳鼻喉頭頸外科開展喉氣道狹窄診治、全耳再造術(shù)、電子耳蝸植入術(shù)等新技術(shù)；心內(nèi)科開展疑難射頻治療；心胸外科開展腋下小切口微創(chuàng)手術(shù)先心治療；胸腔鏡、腹腔鏡、內(nèi)窺鏡診療數(shù)量持續(xù)增長。在人文醫(yī)院方面，率先提出并建設(shè)兒童友好型醫(yī)院，獲得國家衛(wèi)健委認可并推廣?！案裆；ㄖ異邸惫强艱DH項目獲得2019年上海交通大學校長獎；“千里送醫(yī)到遵義”先心病篩查與愛心手術(shù)成為上海援黔重點項目；“彩虹灣病房學?！薄ⅰ盀榘籽』純壕璋l(fā)”獲得全國青年志愿服務(wù)項目大賽金獎；“逐夢螢火蟲”西部兒科醫(yī)護人員進修計劃成為兒科系統(tǒng)培訓品牌；“四葉草”人文醫(yī)院服務(wù)模式獲得2019年中國醫(yī)院人文建設(shè)創(chuàng)新案例。在智慧醫(yī)院方面，作為上海交通大學中國醫(yī)院發(fā)展研究院醫(yī)療信息研究所依托單位，醫(yī)院率先提出并建設(shè)基于“5R”模型的智慧醫(yī)院，獲得2020年首屆上海市醫(yī)院管理創(chuàng)新一等獎。作為2020年上海第一批上線的互聯(lián)網(wǎng)醫(yī)院，引領(lǐng)了上海互聯(lián)網(wǎng)醫(yī)療的發(fā)展，并獲得中國“十大互聯(lián)網(wǎng)+醫(yī)療服務(wù)創(chuàng)新醫(yī)院”品牌稱號。
醫(yī)院作為上海交通大學醫(yī)學院的附屬醫(yī)院，設(shè)有博士、碩士專業(yè)點及博士后流動站。與美國、加拿大、俄羅斯、澳大利亞、日本、新加坡、韓國、英國等國的醫(yī)療機構(gòu)建立了緊密的合作關(guān)系。近5年來醫(yī)院承擔了包括國家科技部重大專項、國家自然科學基金項目、教育部及上海市科委基金項目、上海市衛(wèi)生健康委及申康醫(yī)院發(fā)展中心等425項科研項目；發(fā)表高質(zhì)量科技論文1557篇，其中SCI論文520篇；獲得省部級、局級科技獎項20余項；牽頭制定國內(nèi)指南/專家共識19項；獲得專利授權(quán)46項。以著名科學家曾溢滔院士領(lǐng)銜的上海醫(yī)學遺傳研究所始終瞄準本學科的國際前沿，主編專著8部，發(fā)表論文500多篇，其中代表性的論文發(fā)表在《Lancet》、《PNAS》、《Nature》、《AmJHumGenet》、《Blood》、《CellResearch》《HumMolGenet》、《HumanMutation》和《DevelopmentBiology》等國際權(quán)威雜志上，先后5次榮獲國家級、20多次榮獲省部級重大科技獎勵，研究成果先后三次被評為“中國十大科技進展”和三次入選“中國基礎(chǔ)研究十大新聞”。